企业申请境外投资备案一般需要经过以下流程：

1.项目规划与材料准备：

1.确定投资项目：企业内部需明确境外投资的项目内容、投资方向、投资目的地、投资规模、投资方式等，制定详细的投资计划和商业计划书，阐述项目的可行性、预期收益、风险评估等情况。同时，准备与境外投资相关的合同协议、竞争分析报告、尽职调查报告（如果是并购项目）等材料。

2.准备企业基础材料：准备好境内投资企业的营业执照副本、法人身份证明、股东身份证明等基础文件，以及能够证明企业财务状况的相关材料，如经审计的财务报表（一般要求企业成立满一年以上），以证明企业具备足够的资金实力和偿债能力进行境外投资。

2.发改委立项：

1.提交申请：根据投资项目的金额和性质，向国家发展改革委或地方发改委提交境外投资项目申请。申请材料包括项目备案申请表、项目可行性研究报告、投资资金来源情况说明、境内投资主体营业执照等。

2.审核与批复：发改委对项目进行审核，对于符合备案条件的项目，颁发项目备案通知书或核准文件。如果是涉及敏感国家和地区、敏感行业的项目，审核可能会更加严格，所需时间也可能会更长。

3.商务部门审批：

1.在线申报：企业登录商务部业务系统统一平台（企业端），注册账号并登录后，在线填报《境内主体信息表》和《境外投资备案表》，并按照要求上传相关电子版材料

2.提交纸质材料（部分地区可能需要）：有些地区可能要求企业将纸质版的申请材料提交至当地商务主管部门。纸质材料应与电子版材料保持一致，包括《境外投资备案表》（加盖企业公章）、境外投资相关合同或协议、董事会决议或出资决议、企业营业执照复印件等。

3.审核与发证：商务部门对企业提交的申请材料进行审查，主要审查境外投资的真实性、合法性和合规性。审查通过后，颁发《企业境外投资证书》。

4.外汇管理局备案：

1.银行办理：企业在获得发改委的备案通知书和商务部门的《企业境外投资证书》后，前往银行办理外汇登记手续。银行会根据企业的申请，在外汇管理局的系统中进行备案登记。

2.审核与监管：外汇管理局对企业的外汇登记申请进行审核，审核通过后，企业可以按照备案的金额和用途进行外汇资金的汇出操作。同时，外汇管理局会对企业的境外投资资金使用情况进行监管。

整个境外投资备案流程耗时可能较长，一般需要 2 - 3 个月甚至更长时间，具体时间取决于项目的复杂程度、审批部门的工作效率以及企业提交材料的完整性和准确性。企业在申请过程中应保持与相关部门的沟通，及时了解申请进度和审批结果。